Siskos Familie
2354, kurz nachdem er die Starfleet Acadamy abschloss, traf er Jennifer Sisko die er da drauf Heiratete. 2355 bekamen er und Jennifer und Benjamin ihr erstes und einziges Kind Jake. 2367 Starb Jennifer auf der U.S.S. Saratoga, welche von einem Borg Kubus zerstört wurde.

2369 zogen Benjamin und Jake auf Deep Space Nine. Dort traf er Jadzia Dax wieder. der vorherige Dax Wirt war Curzon. Er war Benjamins Mentor und bester Freund. Die Freundschaft zum "alten Mann" wurde wieder aufgebaut und Jadzias Ratschläge helfen ihm oft weiter.

2374 stirbt Jadzia. Ein Jahr später erfährt er von seinem Vater und einigen Visionen der Propheten das seine Mutter ein Prophet ist. Außerdem kommt Ezri Dax in sein Leben und er heiratet Kesidy Yates, von welcher er auch ein Kind erwartet.

2375, nach dem Dominion Krieg, geht er ins Wurmloch wo er bis heute ist.

Sisko im Dominon Krieg
Benjamin Sisko ist ein wichtiger Offizier im Dominion Krieg. Unter anderem weil er Commander auf Deep Space Nine, der Station neben dem Tor zum Gamma Quadranten und somit auch zum Dominion und Commander der U.S.S. Defiant ist, dem ersten Kriegsschiff der Sternenflotte, welches sogar eine Tarnvorrichtung hat.

2374 lassen die Propheten eine ganze Dominion Flotte auf sein raten hin verschwinden und er kann dadurch Deep Space Nine, welches kurzzeitig vom Dominion besetzt wurde, zurückerobern.

2375 kann er mit Hilfe der Flotte aus Föderation, Romulanern, Klingonen und Cardassianiern das Dominion im Alpha Quadranten besiegen.

Sisko und die Propheten
Als Benjamin Sisko 2369 auf Deep Space Nine stationiert wird hält er nicht sehr viel von diesem Posten. Er ändert jedoch seine Meinung als er mit Lt. Jadzia Dax im Denorius Gürtel das Bajoranische Wurmloch - den Himmelstempel, wie ihn die Bajoranier ihn nennen - entdeckt. Mit dem Wurmloch kann man in Sekunden schnelle in den Gamma Quadranten Reisen.

Im Wurmloch sprechen Wesen, Propheten, mit ihm. Sie leben nicht linear wie alle anderen normalen wesen, sondern Zeitlos. Sisko wird darauf hin zum Abgesandten der Propheten ernannt und wird so zur Religiösen Ikone der Bajoraner. Noch gefällt ihm seine neue Rolle nicht, dies ändert sich jedoch im Laufe der Jahre und einigen Visionen.

Sisko kann die versunkene Stadt B'Hala entdecken - wonach die Bajoraner Jahrhunderte nach gesucht haben. Er verhindert auch das Bajor ein Mitglied der Föderation wird, weil ihm dies die Propheten in einer Vision sagen.

2374 muss er mit ansehen wie "Die Abrechnung" auf Deep Space Nine ausgetragen wird. Ein Kampf zwischen Prophet und Pah' Geist, welcher sich als "Gefäß" seinen Sohn Jake ausgesucht hat.

2375 sind alle Bajoranischen Drehkörper erloschen und das Wurmloch verschwunden. Sisko kann sie, in dem er den Drehkörper des Abgesandten findet, wieder aktivieren und das Wurmloch wieder öffnen.

Er geht nachdem er die Pah' Geister für immer in die Feuerhöhlen auf Bajor verbannt hat, ins Wurmloch.

Neben der Schauspielerei ist er auch ein begabter Jazzsänger. Er studierte erst an dem Oberlin College wechselte jedoch später zur Rutgers Universität. Dort erhielt er als erster Afroamerikaner einen Abschluss in Schauspiel und Regie. In der selben Universität unterrichtete er zwischen 1972 und 1985 auch selber Schauspiel. Nach einigen Erfolgen in Film und Fernsehen blieb ihm für den Unterricht immer weniger Zeit was er mehr als einmal bereute.